Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDE8

Mfsd13a, Transmembrane protein 180, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd13aQ6PDE8 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Mfsd13aQ6PDE8 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms