Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZK9

CARMIL1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, humanhuman

Predictions only

Length 1,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL1Q5VZK9 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CARMIL1Q5VZK9 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
CARMIL1Q5VZK9 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.37
CARMIL1Q5VZK9 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
CARMIL1Q5VZK9 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.37
CARMIL1Q5VZK9 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
CARMIL1Q5VZK9 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
CARMIL1Q5VZK9 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CARMIL1Q5VZK9 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CARMIL1Q5VZK9 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CARMIL1Q5VZK9 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CARMIL1Q5VZK9 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CARMIL1Q5VZK9 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CARMIL1Q5VZK9 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CARMIL1Q5VZK9 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CARMIL1Q5VZK9 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CARMIL1Q5VZK9 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CARMIL1Q5VZK9 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CARMIL1Q5VZK9 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CARMIL1Q5VZK9 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CARMIL1Q5VZK9 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CARMIL1Q5VZK9 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CARMIL1Q5VZK9 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CARMIL1Q5VZK9 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CARMIL1Q5VZK9 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CARMIL1Q5VZK9 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CARMIL1Q5VZK9 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CARMIL1Q5VZK9 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CARMIL1Q5VZK9 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
CARMIL1Q5VZK9 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CARMIL1Q5VZK9 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
CARMIL1Q5VZK9 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CARMIL1Q5VZK9 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
CARMIL1Q5VZK9 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CARMIL1Q5VZK9 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CARMIL1Q5VZK9 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
CARMIL1Q5VZK9 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CARMIL1Q5VZK9 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CARMIL1Q5VZK9 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CARMIL1Q5VZK9 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CARMIL1Q5VZK9 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CARMIL1Q5VZK9 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CARMIL1Q5VZK9 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CARMIL1Q5VZK9 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CARMIL1Q5VZK9 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CARMIL1Q5VZK9 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CARMIL1Q5VZK9 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CARMIL1Q5VZK9 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CARMIL1Q5VZK9 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CARMIL1Q5VZK9 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CARMIL1Q5VZK9 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CARMIL1Q5VZK9 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CARMIL1Q5VZK9 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CARMIL1Q5VZK9 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CARMIL1Q5VZK9 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
CARMIL1Q5VZK9 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CARMIL1Q5VZK9 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CARMIL1Q5VZK9 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CARMIL1Q5VZK9 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CARMIL1Q5VZK9 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CARMIL1Q5VZK9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CARMIL1Q5VZK9 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CARMIL1Q5VZK9 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CARMIL1Q5VZK9 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CARMIL1Q5VZK9 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
CARMIL1Q5VZK9 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
CARMIL1Q5VZK9 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CARMIL1Q5VZK9 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CARMIL1Q5VZK9 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CARMIL1Q5VZK9 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CARMIL1Q5VZK9 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CARMIL1Q5VZK9 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CARMIL1Q5VZK9 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CARMIL1Q5VZK9 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CARMIL1Q5VZK9 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CARMIL1Q5VZK9 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CARMIL1Q5VZK9 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CARMIL1Q5VZK9 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CARMIL1Q5VZK9 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CARMIL1Q5VZK9 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CARMIL1Q5VZK9 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CARMIL1Q5VZK9 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CARMIL1Q5VZK9 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
CARMIL1Q5VZK9 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CARMIL1Q5VZK9 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CARMIL1Q5VZK9 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CARMIL1Q5VZK9 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CARMIL1Q5VZK9 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CARMIL1Q5VZK9 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CARMIL1Q5VZK9 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CARMIL1Q5VZK9 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CARMIL1Q5VZK9 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CARMIL1Q5VZK9 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CARMIL1Q5VZK9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CARMIL1Q5VZK9 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
CARMIL1Q5VZK9 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CARMIL1Q5VZK9 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CARMIL1Q5VZK9 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CARMIL1Q5VZK9 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CARMIL1Q5VZK9 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms