Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWW1

C1QL3, Complement C1q-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QL3Q5VWW1 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C1QL3Q5VWW1 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
C1QL3Q5VWW1 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C1QL3Q5VWW1 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
C1QL3Q5VWW1 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C1QL3Q5VWW1 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C1QL3Q5VWW1 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C1QL3Q5VWW1 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
C1QL3Q5VWW1 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C1QL3Q5VWW1 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C1QL3Q5VWW1 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C1QL3Q5VWW1 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C1QL3Q5VWW1 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C1QL3Q5VWW1 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms