Protein–RNA interactions for Protein: Q2Q1W2

TRIM71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 868 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM71Q2Q1W2 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM71Q2Q1W2 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms