Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDSNQ15517 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms