Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
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