Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CUL1Q13616 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms