Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM27E3Q08E93 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms