Protein–RNA interactions for Protein: Q00169

PITPNA, Phosphatidylinositol transfer protein alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNAQ00169 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITPNAQ00169 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms