Protein–RNA interactions for Protein: P52948

NUP98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, humanhuman

Predictions only

Length 1,817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP98P52948 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUP98P52948 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUP98P52948 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUP98P52948 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUP98P52948 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUP98P52948 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUP98P52948 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NUP98P52948 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUP98P52948 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUP98P52948 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUP98P52948 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUP98P52948 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP98P52948 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP98P52948 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP98P52948 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP98P52948 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP98P52948 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP98P52948 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP98P52948 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP98P52948 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP98P52948 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP98P52948 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP98P52948 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP98P52948 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP98P52948 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP98P52948 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP98P52948 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP98P52948 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP98P52948 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP98P52948 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP98P52948 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP98P52948 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP98P52948 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP98P52948 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP98P52948 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP98P52948 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP98P52948 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP98P52948 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP98P52948 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP98P52948 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP98P52948 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP98P52948 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
NUP98P52948 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
NUP98P52948 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
NUP98P52948 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
NUP98P52948 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUP98P52948 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUP98P52948 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUP98P52948 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUP98P52948 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUP98P52948 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUP98P52948 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUP98P52948 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUP98P52948 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUP98P52948 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUP98P52948 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUP98P52948 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NUP98P52948 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUP98P52948 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUP98P52948 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUP98P52948 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUP98P52948 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP98P52948 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP98P52948 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP98P52948 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP98P52948 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP98P52948 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP98P52948 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP98P52948 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP98P52948 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP98P52948 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP98P52948 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP98P52948 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP98P52948 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP98P52948 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP98P52948 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP98P52948 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP98P52948 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP98P52948 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP98P52948 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP98P52948 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUP98P52948 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUP98P52948 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NUP98P52948 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUP98P52948 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUP98P52948 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUP98P52948 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUP98P52948 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUP98P52948 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUP98P52948 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUP98P52948 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NUP98P52948 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUP98P52948 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUP98P52948 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUP98P52948 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUP98P52948 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUP98P52948 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUP98P52948 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUP98P52948 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUP98P52948 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms