Protein–RNA interactions for Protein: P31644

GABRA5, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA5P31644 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABRA5P31644 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms