Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CLIP1P30622 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CLIP1P30622 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CLIP1P30622 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CLIP1P30622 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CLIP1P30622 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CLIP1P30622 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
CLIP1P30622 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CLIP1P30622 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CLIP1P30622 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CLIP1P30622 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CLIP1P30622 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CLIP1P30622 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CLIP1P30622 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CLIP1P30622 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CLIP1P30622 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CLIP1P30622 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CLIP1P30622 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CLIP1P30622 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CLIP1P30622 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
CLIP1P30622 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CLIP1P30622 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CLIP1P30622 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CLIP1P30622 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CLIP1P30622 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CLIP1P30622 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CLIP1P30622 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CLIP1P30622 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CLIP1P30622 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CLIP1P30622 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CLIP1P30622 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CLIP1P30622 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CLIP1P30622 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CLIP1P30622 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CLIP1P30622 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CLIP1P30622 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CLIP1P30622 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CLIP1P30622 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CLIP1P30622 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CLIP1P30622 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CLIP1P30622 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CLIP1P30622 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CLIP1P30622 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CLIP1P30622 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CLIP1P30622 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CLIP1P30622 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CLIP1P30622 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CLIP1P30622 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CLIP1P30622 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CLIP1P30622 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CLIP1P30622 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CLIP1P30622 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CLIP1P30622 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CLIP1P30622 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CLIP1P30622 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CLIP1P30622 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CLIP1P30622 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CLIP1P30622 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CLIP1P30622 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CLIP1P30622 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CLIP1P30622 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CLIP1P30622 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CLIP1P30622 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CLIP1P30622 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CLIP1P30622 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CLIP1P30622 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CLIP1P30622 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CLIP1P30622 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CLIP1P30622 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CLIP1P30622 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CLIP1P30622 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
CLIP1P30622 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CLIP1P30622 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CLIP1P30622 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CLIP1P30622 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
CLIP1P30622 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CLIP1P30622 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CLIP1P30622 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CLIP1P30622 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CLIP1P30622 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CLIP1P30622 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CLIP1P30622 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CLIP1P30622 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
CLIP1P30622 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
CLIP1P30622 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CLIP1P30622 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CLIP1P30622 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CLIP1P30622 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CLIP1P30622 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CLIP1P30622 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CLIP1P30622 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CLIP1P30622 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CLIP1P30622 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
CLIP1P30622 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CLIP1P30622 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CLIP1P30622 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CLIP1P30622 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CLIP1P30622 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
CLIP1P30622 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
CLIP1P30622 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms