Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HMGB2P26583 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HMGB2P26583 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HMGB2P26583 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HMGB2P26583 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HMGB2P26583 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HMGB2P26583 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HMGB2P26583 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HMGB2P26583 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HMGB2P26583 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HMGB2P26583 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HMGB2P26583 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HMGB2P26583 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HMGB2P26583 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HMGB2P26583 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HMGB2P26583 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HMGB2P26583 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HMGB2P26583 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HMGB2P26583 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HMGB2P26583 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HMGB2P26583 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HMGB2P26583 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HMGB2P26583 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HMGB2P26583 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HMGB2P26583 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HMGB2P26583 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HMGB2P26583 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HMGB2P26583 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HMGB2P26583 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HMGB2P26583 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HMGB2P26583 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HMGB2P26583 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HMGB2P26583 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HMGB2P26583 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HMGB2P26583 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HMGB2P26583 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HMGB2P26583 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HMGB2P26583 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HMGB2P26583 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HMGB2P26583 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HMGB2P26583 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HMGB2P26583 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HMGB2P26583 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HMGB2P26583 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HMGB2P26583 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HMGB2P26583 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HMGB2P26583 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HMGB2P26583 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HMGB2P26583 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HMGB2P26583 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HMGB2P26583 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HMGB2P26583 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HMGB2P26583 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HMGB2P26583 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HMGB2P26583 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HMGB2P26583 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HMGB2P26583 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HMGB2P26583 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HMGB2P26583 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HMGB2P26583 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HMGB2P26583 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HMGB2P26583 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HMGB2P26583 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HMGB2P26583 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HMGB2P26583 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HMGB2P26583 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HMGB2P26583 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HMGB2P26583 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HMGB2P26583 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HMGB2P26583 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
HMGB2P26583 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HMGB2P26583 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HMGB2P26583 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HMGB2P26583 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
HMGB2P26583 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HMGB2P26583 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HMGB2P26583 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HMGB2P26583 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HMGB2P26583 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HMGB2P26583 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
HMGB2P26583 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HMGB2P26583 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HMGB2P26583 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HMGB2P26583 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HMGB2P26583 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HMGB2P26583 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms