Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCL3L1P16619 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms