Protein–RNA interactions for Protein: P16452

EPB42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB42P16452 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EPB42P16452 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EPB42P16452 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EPB42P16452 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EPB42P16452 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPB42P16452 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPB42P16452 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPB42P16452 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPB42P16452 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPB42P16452 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPB42P16452 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPB42P16452 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPB42P16452 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPB42P16452 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPB42P16452 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPB42P16452 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPB42P16452 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPB42P16452 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPB42P16452 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPB42P16452 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPB42P16452 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPB42P16452 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPB42P16452 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
EPB42P16452 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPB42P16452 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
EPB42P16452 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPB42P16452 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPB42P16452 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPB42P16452 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPB42P16452 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPB42P16452 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPB42P16452 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPB42P16452 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPB42P16452 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPB42P16452 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
EPB42P16452 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPB42P16452 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPB42P16452 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPB42P16452 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPB42P16452 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPB42P16452 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPB42P16452 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EPB42P16452 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EPB42P16452 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
EPB42P16452 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EPB42P16452 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EPB42P16452 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EPB42P16452 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EPB42P16452 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EPB42P16452 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EPB42P16452 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EPB42P16452 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EPB42P16452 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EPB42P16452 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EPB42P16452 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
EPB42P16452 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EPB42P16452 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EPB42P16452 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
EPB42P16452 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EPB42P16452 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EPB42P16452 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EPB42P16452 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EPB42P16452 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EPB42P16452 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EPB42P16452 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
EPB42P16452 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EPB42P16452 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EPB42P16452 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
EPB42P16452 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EPB42P16452 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPB42P16452 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPB42P16452 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPB42P16452 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPB42P16452 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPB42P16452 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPB42P16452 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPB42P16452 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPB42P16452 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPB42P16452 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPB42P16452 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPB42P16452 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPB42P16452 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPB42P16452 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPB42P16452 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPB42P16452 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPB42P16452 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPB42P16452 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
EPB42P16452 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPB42P16452 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPB42P16452 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPB42P16452 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPB42P16452 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPB42P16452 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPB42P16452 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPB42P16452 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPB42P16452 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPB42P16452 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPB42P16452 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPB42P16452 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EPB42P16452 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms