Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHGAP10645 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHGAP10645 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CHGAP10645 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHGAP10645 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHGAP10645 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CHGAP10645 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHGAP10645 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHGAP10645 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHGAP10645 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHGAP10645 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHGAP10645 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CHGAP10645 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHGAP10645 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHGAP10645 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHGAP10645 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHGAP10645 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHGAP10645 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHGAP10645 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHGAP10645 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHGAP10645 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHGAP10645 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHGAP10645 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHGAP10645 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHGAP10645 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHGAP10645 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CHGAP10645 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHGAP10645 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHGAP10645 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHGAP10645 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHGAP10645 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHGAP10645 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHGAP10645 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHGAP10645 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHGAP10645 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CHGAP10645 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHGAP10645 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHGAP10645 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHGAP10645 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHGAP10645 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHGAP10645 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CHGAP10645 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHGAP10645 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHGAP10645 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHGAP10645 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHGAP10645 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHGAP10645 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHGAP10645 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHGAP10645 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHGAP10645 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHGAP10645 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHGAP10645 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHGAP10645 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHGAP10645 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHGAP10645 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHGAP10645 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHGAP10645 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHGAP10645 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHGAP10645 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHGAP10645 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHGAP10645 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CHGAP10645 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHGAP10645 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHGAP10645 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHGAP10645 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHGAP10645 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHGAP10645 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHGAP10645 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHGAP10645 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHGAP10645 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHGAP10645 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHGAP10645 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHGAP10645 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHGAP10645 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHGAP10645 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHGAP10645 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CHGAP10645 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CHGAP10645 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHGAP10645 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHGAP10645 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHGAP10645 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHGAP10645 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHGAP10645 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHGAP10645 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHGAP10645 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHGAP10645 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHGAP10645 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHGAP10645 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHGAP10645 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHGAP10645 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHGAP10645 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHGAP10645 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHGAP10645 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHGAP10645 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHGAP10645 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHGAP10645 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHGAP10645 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHGAP10645 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHGAP10645 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHGAP10645 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms