Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HTATSF1O43719 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
HTATSF1O43719 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HTATSF1O43719 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HTATSF1O43719 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HTATSF1O43719 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HTATSF1O43719 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HTATSF1O43719 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HTATSF1O43719 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HTATSF1O43719 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HTATSF1O43719 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HTATSF1O43719 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HTATSF1O43719 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HTATSF1O43719 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
HTATSF1O43719 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HTATSF1O43719 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
HTATSF1O43719 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HTATSF1O43719 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HTATSF1O43719 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HTATSF1O43719 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HTATSF1O43719 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HTATSF1O43719 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HTATSF1O43719 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HTATSF1O43719 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HTATSF1O43719 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HTATSF1O43719 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HTATSF1O43719 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HTATSF1O43719 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HTATSF1O43719 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HTATSF1O43719 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HTATSF1O43719 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HTATSF1O43719 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HTATSF1O43719 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HTATSF1O43719 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HTATSF1O43719 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
HTATSF1O43719 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HTATSF1O43719 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HTATSF1O43719 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HTATSF1O43719 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HTATSF1O43719 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms