Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ARID3CA6NKF2 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ARID3CA6NKF2 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ARID3CA6NKF2 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ARID3CA6NKF2 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
ARID3CA6NKF2 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ARID3CA6NKF2 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ARID3CA6NKF2 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ARID3CA6NKF2 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ARID3CA6NKF2 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ARID3CA6NKF2 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ARID3CA6NKF2 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ARID3CA6NKF2 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ARID3CA6NKF2 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ARID3CA6NKF2 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ARID3CA6NKF2 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ARID3CA6NKF2 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ARID3CA6NKF2 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ARID3CA6NKF2 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ARID3CA6NKF2 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ARID3CA6NKF2 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ARID3CA6NKF2 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ARID3CA6NKF2 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ARID3CA6NKF2 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ARID3CA6NKF2 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ARID3CA6NKF2 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ARID3CA6NKF2 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ARID3CA6NKF2 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ARID3CA6NKF2 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ARID3CA6NKF2 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ARID3CA6NKF2 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
ARID3CA6NKF2 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ARID3CA6NKF2 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ARID3CA6NKF2 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
ARID3CA6NKF2 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ARID3CA6NKF2 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ARID3CA6NKF2 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ARID3CA6NKF2 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ARID3CA6NKF2 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ARID3CA6NKF2 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
ARID3CA6NKF2 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
ARID3CA6NKF2 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ARID3CA6NKF2 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ARID3CA6NKF2 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
ARID3CA6NKF2 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
ARID3CA6NKF2 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
ARID3CA6NKF2 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
ARID3CA6NKF2 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ARID3CA6NKF2 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ARID3CA6NKF2 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ARID3CA6NKF2 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
ARID3CA6NKF2 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ARID3CA6NKF2 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
ARID3CA6NKF2 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ARID3CA6NKF2 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ARID3CA6NKF2 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ARID3CA6NKF2 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ARID3CA6NKF2 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ARID3CA6NKF2 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ARID3CA6NKF2 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ARID3CA6NKF2 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
ARID3CA6NKF2 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ARID3CA6NKF2 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ARID3CA6NKF2 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ARID3CA6NKF2 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ARID3CA6NKF2 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ARID3CA6NKF2 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
ARID3CA6NKF2 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ARID3CA6NKF2 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ARID3CA6NKF2 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ARID3CA6NKF2 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ARID3CA6NKF2 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ARID3CA6NKF2 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ARID3CA6NKF2 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ARID3CA6NKF2 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ARID3CA6NKF2 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ARID3CA6NKF2 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ARID3CA6NKF2 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ARID3CA6NKF2 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ARID3CA6NKF2 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
ARID3CA6NKF2 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ARID3CA6NKF2 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ARID3CA6NKF2 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ARID3CA6NKF2 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ARID3CA6NKF2 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ARID3CA6NKF2 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ARID3CA6NKF2 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ARID3CA6NKF2 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ARID3CA6NKF2 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ARID3CA6NKF2 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ARID3CA6NKF2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ARID3CA6NKF2 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ARID3CA6NKF2 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ARID3CA6NKF2 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ARID3CA6NKF2 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ARID3CA6NKF2 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ARID3CA6NKF2 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ARID3CA6NKF2 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ARID3CA6NKF2 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ARID3CA6NKF2 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms