Protein–RNA interactions for Protein: A6NGB9

WIPF3, WAS/WASL-interacting protein family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WIPF3A6NGB9 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
WIPF3A6NGB9 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
WIPF3A6NGB9 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
WIPF3A6NGB9 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
WIPF3A6NGB9 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
WIPF3A6NGB9 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
WIPF3A6NGB9 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
WIPF3A6NGB9 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
WIPF3A6NGB9 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
WIPF3A6NGB9 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
WIPF3A6NGB9 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
WIPF3A6NGB9 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
WIPF3A6NGB9 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
WIPF3A6NGB9 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
WIPF3A6NGB9 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
WIPF3A6NGB9 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
WIPF3A6NGB9 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
WIPF3A6NGB9 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
WIPF3A6NGB9 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
WIPF3A6NGB9 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
WIPF3A6NGB9 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
WIPF3A6NGB9 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
WIPF3A6NGB9 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
WIPF3A6NGB9 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
WIPF3A6NGB9 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
WIPF3A6NGB9 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
WIPF3A6NGB9 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
WIPF3A6NGB9 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
WIPF3A6NGB9 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
WIPF3A6NGB9 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
WIPF3A6NGB9 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
WIPF3A6NGB9 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
WIPF3A6NGB9 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
WIPF3A6NGB9 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
WIPF3A6NGB9 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
WIPF3A6NGB9 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
WIPF3A6NGB9 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
WIPF3A6NGB9 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
WIPF3A6NGB9 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
WIPF3A6NGB9 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
WIPF3A6NGB9 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
WIPF3A6NGB9 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
WIPF3A6NGB9 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
WIPF3A6NGB9 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
WIPF3A6NGB9 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
WIPF3A6NGB9 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
WIPF3A6NGB9 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
WIPF3A6NGB9 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
WIPF3A6NGB9 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
WIPF3A6NGB9 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
WIPF3A6NGB9 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
WIPF3A6NGB9 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
WIPF3A6NGB9 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
WIPF3A6NGB9 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
WIPF3A6NGB9 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
WIPF3A6NGB9 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
WIPF3A6NGB9 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
WIPF3A6NGB9 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
WIPF3A6NGB9 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
WIPF3A6NGB9 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
WIPF3A6NGB9 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
WIPF3A6NGB9 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
WIPF3A6NGB9 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
WIPF3A6NGB9 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
WIPF3A6NGB9 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
WIPF3A6NGB9 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
WIPF3A6NGB9 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
WIPF3A6NGB9 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
WIPF3A6NGB9 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
WIPF3A6NGB9 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
WIPF3A6NGB9 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
WIPF3A6NGB9 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
WIPF3A6NGB9 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
WIPF3A6NGB9 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
WIPF3A6NGB9 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
WIPF3A6NGB9 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
WIPF3A6NGB9 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
WIPF3A6NGB9 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
WIPF3A6NGB9 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
WIPF3A6NGB9 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
WIPF3A6NGB9 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
WIPF3A6NGB9 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
WIPF3A6NGB9 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
WIPF3A6NGB9 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
WIPF3A6NGB9 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
WIPF3A6NGB9 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
WIPF3A6NGB9 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
WIPF3A6NGB9 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
WIPF3A6NGB9 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
WIPF3A6NGB9 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
WIPF3A6NGB9 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
WIPF3A6NGB9 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
WIPF3A6NGB9 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
WIPF3A6NGB9 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
WIPF3A6NGB9 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
WIPF3A6NGB9 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
WIPF3A6NGB9 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
WIPF3A6NGB9 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
WIPF3A6NGB9 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
WIPF3A6NGB9 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms