Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GOLGA6L9A6NEM1 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms