Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms