Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULG1

INO80, DNA helicase INO80, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80Q9ULG1 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
INO80Q9ULG1 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
INO80Q9ULG1 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
INO80Q9ULG1 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
INO80Q9ULG1 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
INO80Q9ULG1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
INO80Q9ULG1 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
INO80Q9ULG1 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
INO80Q9ULG1 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
INO80Q9ULG1 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
INO80Q9ULG1 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
INO80Q9ULG1 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
INO80Q9ULG1 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
INO80Q9ULG1 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
INO80Q9ULG1 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
INO80Q9ULG1 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
INO80Q9ULG1 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
INO80Q9ULG1 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
INO80Q9ULG1 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
INO80Q9ULG1 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
INO80Q9ULG1 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
INO80Q9ULG1 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
INO80Q9ULG1 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
INO80Q9ULG1 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
INO80Q9ULG1 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
INO80Q9ULG1 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
INO80Q9ULG1 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
INO80Q9ULG1 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
INO80Q9ULG1 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
INO80Q9ULG1 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
INO80Q9ULG1 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
INO80Q9ULG1 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
INO80Q9ULG1 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
INO80Q9ULG1 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
INO80Q9ULG1 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
INO80Q9ULG1 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
INO80Q9ULG1 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
INO80Q9ULG1 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
INO80Q9ULG1 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
INO80Q9ULG1 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
INO80Q9ULG1 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
INO80Q9ULG1 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
INO80Q9ULG1 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
INO80Q9ULG1 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
INO80Q9ULG1 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
INO80Q9ULG1 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
INO80Q9ULG1 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
INO80Q9ULG1 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
INO80Q9ULG1 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
INO80Q9ULG1 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
INO80Q9ULG1 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
INO80Q9ULG1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
INO80Q9ULG1 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
INO80Q9ULG1 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
INO80Q9ULG1 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
INO80Q9ULG1 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
INO80Q9ULG1 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
INO80Q9ULG1 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
INO80Q9ULG1 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
INO80Q9ULG1 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
INO80Q9ULG1 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
INO80Q9ULG1 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
INO80Q9ULG1 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
INO80Q9ULG1 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
INO80Q9ULG1 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
INO80Q9ULG1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
INO80Q9ULG1 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
INO80Q9ULG1 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
INO80Q9ULG1 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
INO80Q9ULG1 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
INO80Q9ULG1 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
INO80Q9ULG1 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
INO80Q9ULG1 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
INO80Q9ULG1 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
INO80Q9ULG1 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
INO80Q9ULG1 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
INO80Q9ULG1 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
INO80Q9ULG1 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
INO80Q9ULG1 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
INO80Q9ULG1 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
INO80Q9ULG1 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
INO80Q9ULG1 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
INO80Q9ULG1 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
INO80Q9ULG1 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
INO80Q9ULG1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
INO80Q9ULG1 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
INO80Q9ULG1 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
INO80Q9ULG1 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
INO80Q9ULG1 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
INO80Q9ULG1 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
INO80Q9ULG1 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
INO80Q9ULG1 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
INO80Q9ULG1 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
INO80Q9ULG1 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
INO80Q9ULG1 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
INO80Q9ULG1 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
INO80Q9ULG1 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
INO80Q9ULG1 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
INO80Q9ULG1 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
INO80Q9ULG1 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms