Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD9

DUOX1, Dual oxidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX1Q9NRD9 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DUOX1Q9NRD9 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DUOX1Q9NRD9 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DUOX1Q9NRD9 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DUOX1Q9NRD9 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DUOX1Q9NRD9 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DUOX1Q9NRD9 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DUOX1Q9NRD9 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DUOX1Q9NRD9 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DUOX1Q9NRD9 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DUOX1Q9NRD9 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DUOX1Q9NRD9 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DUOX1Q9NRD9 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DUOX1Q9NRD9 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DUOX1Q9NRD9 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DUOX1Q9NRD9 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DUOX1Q9NRD9 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DUOX1Q9NRD9 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DUOX1Q9NRD9 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DUOX1Q9NRD9 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DUOX1Q9NRD9 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DUOX1Q9NRD9 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DUOX1Q9NRD9 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DUOX1Q9NRD9 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DUOX1Q9NRD9 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DUOX1Q9NRD9 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DUOX1Q9NRD9 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DUOX1Q9NRD9 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DUOX1Q9NRD9 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DUOX1Q9NRD9 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DUOX1Q9NRD9 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DUOX1Q9NRD9 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DUOX1Q9NRD9 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DUOX1Q9NRD9 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
DUOX1Q9NRD9 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DUOX1Q9NRD9 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DUOX1Q9NRD9 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DUOX1Q9NRD9 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DUOX1Q9NRD9 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DUOX1Q9NRD9 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DUOX1Q9NRD9 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
DUOX1Q9NRD9 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms