Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
RAB9BQ9NP90 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms