Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
KIAA1549Q9HCM3 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KIAA1549Q9HCM3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms