Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM2

PLXNA4, Plexin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA4Q9HCM2 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PLXNA4Q9HCM2 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PLXNA4Q9HCM2 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PLXNA4Q9HCM2 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PLXNA4Q9HCM2 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PLXNA4Q9HCM2 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PLXNA4Q9HCM2 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PLXNA4Q9HCM2 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PLXNA4Q9HCM2 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PLXNA4Q9HCM2 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PLXNA4Q9HCM2 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PLXNA4Q9HCM2 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PLXNA4Q9HCM2 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PLXNA4Q9HCM2 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PLXNA4Q9HCM2 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PLXNA4Q9HCM2 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PLXNA4Q9HCM2 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PLXNA4Q9HCM2 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PLXNA4Q9HCM2 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PLXNA4Q9HCM2 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PLXNA4Q9HCM2 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PLXNA4Q9HCM2 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PLXNA4Q9HCM2 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PLXNA4Q9HCM2 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PLXNA4Q9HCM2 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PLXNA4Q9HCM2 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PLXNA4Q9HCM2 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PLXNA4Q9HCM2 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PLXNA4Q9HCM2 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PLXNA4Q9HCM2 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PLXNA4Q9HCM2 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PLXNA4Q9HCM2 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PLXNA4Q9HCM2 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PLXNA4Q9HCM2 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PLXNA4Q9HCM2 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PLXNA4Q9HCM2 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PLXNA4Q9HCM2 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PLXNA4Q9HCM2 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PLXNA4Q9HCM2 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PLXNA4Q9HCM2 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PLXNA4Q9HCM2 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PLXNA4Q9HCM2 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PLXNA4Q9HCM2 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PLXNA4Q9HCM2 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PLXNA4Q9HCM2 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PLXNA4Q9HCM2 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PLXNA4Q9HCM2 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PLXNA4Q9HCM2 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PLXNA4Q9HCM2 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PLXNA4Q9HCM2 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PLXNA4Q9HCM2 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PLXNA4Q9HCM2 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PLXNA4Q9HCM2 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PLXNA4Q9HCM2 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PLXNA4Q9HCM2 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PLXNA4Q9HCM2 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PLXNA4Q9HCM2 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PLXNA4Q9HCM2 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PLXNA4Q9HCM2 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PLXNA4Q9HCM2 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PLXNA4Q9HCM2 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PLXNA4Q9HCM2 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PLXNA4Q9HCM2 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PLXNA4Q9HCM2 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PLXNA4Q9HCM2 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PLXNA4Q9HCM2 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PLXNA4Q9HCM2 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PLXNA4Q9HCM2 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PLXNA4Q9HCM2 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PLXNA4Q9HCM2 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PLXNA4Q9HCM2 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PLXNA4Q9HCM2 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PLXNA4Q9HCM2 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PLXNA4Q9HCM2 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PLXNA4Q9HCM2 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PLXNA4Q9HCM2 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PLXNA4Q9HCM2 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PLXNA4Q9HCM2 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PLXNA4Q9HCM2 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PLXNA4Q9HCM2 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PLXNA4Q9HCM2 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PLXNA4Q9HCM2 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PLXNA4Q9HCM2 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PLXNA4Q9HCM2 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PLXNA4Q9HCM2 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PLXNA4Q9HCM2 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PLXNA4Q9HCM2 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PLXNA4Q9HCM2 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PLXNA4Q9HCM2 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PLXNA4Q9HCM2 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PLXNA4Q9HCM2 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PLXNA4Q9HCM2 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PLXNA4Q9HCM2 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PLXNA4Q9HCM2 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PLXNA4Q9HCM2 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PLXNA4Q9HCM2 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PLXNA4Q9HCM2 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PLXNA4Q9HCM2 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PLXNA4Q9HCM2 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PLXNA4Q9HCM2 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms