Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
SCAPERQ9BY12 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SCAPERQ9BY12 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SCAPERQ9BY12 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SCAPERQ9BY12 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SCAPERQ9BY12 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SCAPERQ9BY12 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SCAPERQ9BY12 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
SCAPERQ9BY12 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SCAPERQ9BY12 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
SCAPERQ9BY12 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SCAPERQ9BY12 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
SCAPERQ9BY12 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SCAPERQ9BY12 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SCAPERQ9BY12 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SCAPERQ9BY12 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SCAPERQ9BY12 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SCAPERQ9BY12 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SCAPERQ9BY12 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SCAPERQ9BY12 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SCAPERQ9BY12 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SCAPERQ9BY12 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SCAPERQ9BY12 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SCAPERQ9BY12 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SCAPERQ9BY12 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SCAPERQ9BY12 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SCAPERQ9BY12 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SCAPERQ9BY12 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
SCAPERQ9BY12 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SCAPERQ9BY12 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SCAPERQ9BY12 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SCAPERQ9BY12 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SCAPERQ9BY12 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SCAPERQ9BY12 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SCAPERQ9BY12 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SCAPERQ9BY12 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SCAPERQ9BY12 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SCAPERQ9BY12 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SCAPERQ9BY12 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SCAPERQ9BY12 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
SCAPERQ9BY12 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SCAPERQ9BY12 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SCAPERQ9BY12 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SCAPERQ9BY12 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SCAPERQ9BY12 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SCAPERQ9BY12 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SCAPERQ9BY12 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SCAPERQ9BY12 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SCAPERQ9BY12 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SCAPERQ9BY12 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SCAPERQ9BY12 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SCAPERQ9BY12 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SCAPERQ9BY12 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SCAPERQ9BY12 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SCAPERQ9BY12 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SCAPERQ9BY12 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SCAPERQ9BY12 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SCAPERQ9BY12 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SCAPERQ9BY12 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SCAPERQ9BY12 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SCAPERQ9BY12 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SCAPERQ9BY12 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SCAPERQ9BY12 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SCAPERQ9BY12 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SCAPERQ9BY12 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SCAPERQ9BY12 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SCAPERQ9BY12 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SCAPERQ9BY12 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SCAPERQ9BY12 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SCAPERQ9BY12 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SCAPERQ9BY12 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SCAPERQ9BY12 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SCAPERQ9BY12 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SCAPERQ9BY12 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SCAPERQ9BY12 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SCAPERQ9BY12 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SCAPERQ9BY12 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SCAPERQ9BY12 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SCAPERQ9BY12 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SCAPERQ9BY12 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SCAPERQ9BY12 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SCAPERQ9BY12 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SCAPERQ9BY12 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SCAPERQ9BY12 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SCAPERQ9BY12 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SCAPERQ9BY12 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SCAPERQ9BY12 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SCAPERQ9BY12 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SCAPERQ9BY12 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SCAPERQ9BY12 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SCAPERQ9BY12 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SCAPERQ9BY12 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SCAPERQ9BY12 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SCAPERQ9BY12 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SCAPERQ9BY12 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SCAPERQ9BY12 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SCAPERQ9BY12 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SCAPERQ9BY12 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SCAPERQ9BY12 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SCAPERQ9BY12 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms