Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY4

RSPO3, R-spondin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO3Q9BXY4 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RSPO3Q9BXY4 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RSPO3Q9BXY4 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RSPO3Q9BXY4 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms