Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY5

CRAMP1, Protein cramped-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRAMP1Q96RY5 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CRAMP1Q96RY5 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CRAMP1Q96RY5 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CRAMP1Q96RY5 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CRAMP1Q96RY5 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CRAMP1Q96RY5 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRAMP1Q96RY5 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRAMP1Q96RY5 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRAMP1Q96RY5 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRAMP1Q96RY5 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CRAMP1Q96RY5 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRAMP1Q96RY5 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRAMP1Q96RY5 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRAMP1Q96RY5 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRAMP1Q96RY5 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CRAMP1Q96RY5 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CRAMP1Q96RY5 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRAMP1Q96RY5 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRAMP1Q96RY5 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CRAMP1Q96RY5 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRAMP1Q96RY5 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRAMP1Q96RY5 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRAMP1Q96RY5 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRAMP1Q96RY5 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRAMP1Q96RY5 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRAMP1Q96RY5 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRAMP1Q96RY5 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRAMP1Q96RY5 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRAMP1Q96RY5 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRAMP1Q96RY5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRAMP1Q96RY5 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRAMP1Q96RY5 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRAMP1Q96RY5 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRAMP1Q96RY5 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRAMP1Q96RY5 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRAMP1Q96RY5 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRAMP1Q96RY5 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRAMP1Q96RY5 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRAMP1Q96RY5 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRAMP1Q96RY5 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRAMP1Q96RY5 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRAMP1Q96RY5 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CRAMP1Q96RY5 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRAMP1Q96RY5 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRAMP1Q96RY5 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRAMP1Q96RY5 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms