Protein–RNA interactions for Protein: Q96F86

EDC3, Enhancer of mRNA-decapping protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC3Q96F86 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
EDC3Q96F86 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EDC3Q96F86 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms