Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP9

SLC10A4, Sodium/bile acid cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A4Q96EP9 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC10A4Q96EP9 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC10A4Q96EP9 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC10A4Q96EP9 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC10A4Q96EP9 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC10A4Q96EP9 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC10A4Q96EP9 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC10A4Q96EP9 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC10A4Q96EP9 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC10A4Q96EP9 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC10A4Q96EP9 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC10A4Q96EP9 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC10A4Q96EP9 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC10A4Q96EP9 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC10A4Q96EP9 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC10A4Q96EP9 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC10A4Q96EP9 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC10A4Q96EP9 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC10A4Q96EP9 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC10A4Q96EP9 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC10A4Q96EP9 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC10A4Q96EP9 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC10A4Q96EP9 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC10A4Q96EP9 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC10A4Q96EP9 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms