Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV16

DCAF4, DDB1- and CUL4-associated factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF4Q8WV16 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC21.3■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC21.3■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC21.3■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC21.3■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC21.29■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC21.29■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC21.27■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC21.27■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC21.27■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC21.27■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC21.27■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
DCAF4Q8WV16 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
DCAF4Q8WV16 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
DCAF4Q8WV16 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
DCAF4Q8WV16 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
DCAF4Q8WV16 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCAF4Q8WV16 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCAF4Q8WV16 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCAF4Q8WV16 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms