Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU4

CCDC191, Coiled-coil domain-containing protein 191, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC191Q8NCU4 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC191Q8NCU4 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC191Q8NCU4 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC191Q8NCU4 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC191Q8NCU4 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC191Q8NCU4 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC191Q8NCU4 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC191Q8NCU4 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC191Q8NCU4 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC191Q8NCU4 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC191Q8NCU4 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC191Q8NCU4 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC191Q8NCU4 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC191Q8NCU4 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC191Q8NCU4 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC191Q8NCU4 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC191Q8NCU4 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC191Q8NCU4 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC191Q8NCU4 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC191Q8NCU4 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC191Q8NCU4 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC191Q8NCU4 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC191Q8NCU4 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC191Q8NCU4 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC191Q8NCU4 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC191Q8NCU4 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC191Q8NCU4 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC191Q8NCU4 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC191Q8NCU4 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC191Q8NCU4 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC191Q8NCU4 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC191Q8NCU4 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC191Q8NCU4 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC191Q8NCU4 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC191Q8NCU4 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC191Q8NCU4 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC191Q8NCU4 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC191Q8NCU4 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC191Q8NCU4 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC191Q8NCU4 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC191Q8NCU4 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC191Q8NCU4 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC191Q8NCU4 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC191Q8NCU4 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC191Q8NCU4 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC191Q8NCU4 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC191Q8NCU4 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC191Q8NCU4 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC191Q8NCU4 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC191Q8NCU4 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC191Q8NCU4 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC191Q8NCU4 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC191Q8NCU4 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC191Q8NCU4 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC191Q8NCU4 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC191Q8NCU4 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC191Q8NCU4 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC191Q8NCU4 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC191Q8NCU4 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC191Q8NCU4 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC191Q8NCU4 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC191Q8NCU4 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC191Q8NCU4 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC191Q8NCU4 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC191Q8NCU4 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC191Q8NCU4 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC191Q8NCU4 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC191Q8NCU4 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC191Q8NCU4 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC191Q8NCU4 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC191Q8NCU4 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC191Q8NCU4 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC191Q8NCU4 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC191Q8NCU4 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC191Q8NCU4 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC191Q8NCU4 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC191Q8NCU4 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC191Q8NCU4 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC191Q8NCU4 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC191Q8NCU4 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC191Q8NCU4 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC191Q8NCU4 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC191Q8NCU4 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC191Q8NCU4 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC191Q8NCU4 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC191Q8NCU4 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC191Q8NCU4 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC191Q8NCU4 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC191Q8NCU4 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC191Q8NCU4 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC191Q8NCU4 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC191Q8NCU4 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC191Q8NCU4 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC191Q8NCU4 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC191Q8NCU4 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC191Q8NCU4 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC191Q8NCU4 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC191Q8NCU4 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC191Q8NCU4 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC191Q8NCU4 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms