Protein–RNA interactions for Protein: Q8N427

NME8, Thioredoxin domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME8Q8N427 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NME8Q8N427 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NME8Q8N427 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NME8Q8N427 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NME8Q8N427 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NME8Q8N427 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NME8Q8N427 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NME8Q8N427 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NME8Q8N427 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NME8Q8N427 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NME8Q8N427 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NME8Q8N427 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NME8Q8N427 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NME8Q8N427 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NME8Q8N427 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NME8Q8N427 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NME8Q8N427 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NME8Q8N427 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NME8Q8N427 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NME8Q8N427 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NME8Q8N427 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NME8Q8N427 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NME8Q8N427 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
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