Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RUFY3Q7L099 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RUFY3Q7L099 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RUFY3Q7L099 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RUFY3Q7L099 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RUFY3Q7L099 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RUFY3Q7L099 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RUFY3Q7L099 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RUFY3Q7L099 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RUFY3Q7L099 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RUFY3Q7L099 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RUFY3Q7L099 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RUFY3Q7L099 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RUFY3Q7L099 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RUFY3Q7L099 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RUFY3Q7L099 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RUFY3Q7L099 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RUFY3Q7L099 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RUFY3Q7L099 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RUFY3Q7L099 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RUFY3Q7L099 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RUFY3Q7L099 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RUFY3Q7L099 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RUFY3Q7L099 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
RUFY3Q7L099 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RUFY3Q7L099 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RUFY3Q7L099 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RUFY3Q7L099 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RUFY3Q7L099 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms