Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV77

C9orf139, Uncharacterized protein C9orf139, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf139Q6ZV77 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C9orf139Q6ZV77 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C9orf139Q6ZV77 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf139Q6ZV77 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf139Q6ZV77 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf139Q6ZV77 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf139Q6ZV77 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf139Q6ZV77 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf139Q6ZV77 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf139Q6ZV77 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf139Q6ZV77 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf139Q6ZV77 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf139Q6ZV77 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf139Q6ZV77 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf139Q6ZV77 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf139Q6ZV77 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf139Q6ZV77 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf139Q6ZV77 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf139Q6ZV77 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf139Q6ZV77 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf139Q6ZV77 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf139Q6ZV77 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf139Q6ZV77 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf139Q6ZV77 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf139Q6ZV77 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf139Q6ZV77 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf139Q6ZV77 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf139Q6ZV77 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf139Q6ZV77 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf139Q6ZV77 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf139Q6ZV77 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf139Q6ZV77 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf139Q6ZV77 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf139Q6ZV77 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf139Q6ZV77 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf139Q6ZV77 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf139Q6ZV77 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf139Q6ZV77 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf139Q6ZV77 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C9orf139Q6ZV77 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C9orf139Q6ZV77 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C9orf139Q6ZV77 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C9orf139Q6ZV77 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C9orf139Q6ZV77 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C9orf139Q6ZV77 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C9orf139Q6ZV77 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C9orf139Q6ZV77 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C9orf139Q6ZV77 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C9orf139Q6ZV77 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C9orf139Q6ZV77 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C9orf139Q6ZV77 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C9orf139Q6ZV77 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C9orf139Q6ZV77 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C9orf139Q6ZV77 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
C9orf139Q6ZV77 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C9orf139Q6ZV77 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
C9orf139Q6ZV77 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C9orf139Q6ZV77 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
C9orf139Q6ZV77 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C9orf139Q6ZV77 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C9orf139Q6ZV77 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
C9orf139Q6ZV77 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C9orf139Q6ZV77 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C9orf139Q6ZV77 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C9orf139Q6ZV77 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C9orf139Q6ZV77 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C9orf139Q6ZV77 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C9orf139Q6ZV77 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C9orf139Q6ZV77 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C9orf139Q6ZV77 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C9orf139Q6ZV77 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C9orf139Q6ZV77 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf139Q6ZV77 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf139Q6ZV77 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf139Q6ZV77 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf139Q6ZV77 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf139Q6ZV77 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf139Q6ZV77 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf139Q6ZV77 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf139Q6ZV77 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf139Q6ZV77 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf139Q6ZV77 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf139Q6ZV77 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf139Q6ZV77 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf139Q6ZV77 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf139Q6ZV77 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf139Q6ZV77 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf139Q6ZV77 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf139Q6ZV77 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf139Q6ZV77 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf139Q6ZV77 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf139Q6ZV77 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf139Q6ZV77 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf139Q6ZV77 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf139Q6ZV77 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf139Q6ZV77 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf139Q6ZV77 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf139Q6ZV77 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf139Q6ZV77 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf139Q6ZV77 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms