Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0Q7

USPL1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, humanhuman

Predictions only

Length 1,092 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USPL1Q5W0Q7 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USPL1Q5W0Q7 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
USPL1Q5W0Q7 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USPL1Q5W0Q7 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USPL1Q5W0Q7 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USPL1Q5W0Q7 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USPL1Q5W0Q7 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USPL1Q5W0Q7 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
USPL1Q5W0Q7 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
USPL1Q5W0Q7 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USPL1Q5W0Q7 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USPL1Q5W0Q7 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USPL1Q5W0Q7 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USPL1Q5W0Q7 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USPL1Q5W0Q7 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USPL1Q5W0Q7 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USPL1Q5W0Q7 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USPL1Q5W0Q7 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USPL1Q5W0Q7 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USPL1Q5W0Q7 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USPL1Q5W0Q7 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USPL1Q5W0Q7 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USPL1Q5W0Q7 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USPL1Q5W0Q7 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USPL1Q5W0Q7 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USPL1Q5W0Q7 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USPL1Q5W0Q7 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
USPL1Q5W0Q7 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
USPL1Q5W0Q7 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
USPL1Q5W0Q7 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USPL1Q5W0Q7 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USPL1Q5W0Q7 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USPL1Q5W0Q7 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USPL1Q5W0Q7 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USPL1Q5W0Q7 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USPL1Q5W0Q7 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USPL1Q5W0Q7 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USPL1Q5W0Q7 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USPL1Q5W0Q7 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USPL1Q5W0Q7 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USPL1Q5W0Q7 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USPL1Q5W0Q7 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
USPL1Q5W0Q7 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USPL1Q5W0Q7 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USPL1Q5W0Q7 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USPL1Q5W0Q7 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USPL1Q5W0Q7 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USPL1Q5W0Q7 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USPL1Q5W0Q7 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USPL1Q5W0Q7 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USPL1Q5W0Q7 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USPL1Q5W0Q7 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USPL1Q5W0Q7 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USPL1Q5W0Q7 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USPL1Q5W0Q7 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USPL1Q5W0Q7 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USPL1Q5W0Q7 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USPL1Q5W0Q7 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USPL1Q5W0Q7 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USPL1Q5W0Q7 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USPL1Q5W0Q7 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USPL1Q5W0Q7 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USPL1Q5W0Q7 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USPL1Q5W0Q7 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USPL1Q5W0Q7 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USPL1Q5W0Q7 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USPL1Q5W0Q7 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USPL1Q5W0Q7 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USPL1Q5W0Q7 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USPL1Q5W0Q7 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USPL1Q5W0Q7 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USPL1Q5W0Q7 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USPL1Q5W0Q7 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USPL1Q5W0Q7 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USPL1Q5W0Q7 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USPL1Q5W0Q7 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USPL1Q5W0Q7 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
USPL1Q5W0Q7 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USPL1Q5W0Q7 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
USPL1Q5W0Q7 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USPL1Q5W0Q7 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USPL1Q5W0Q7 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USPL1Q5W0Q7 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USPL1Q5W0Q7 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USPL1Q5W0Q7 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USPL1Q5W0Q7 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USPL1Q5W0Q7 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USPL1Q5W0Q7 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
USPL1Q5W0Q7 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USPL1Q5W0Q7 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USPL1Q5W0Q7 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USPL1Q5W0Q7 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USPL1Q5W0Q7 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USPL1Q5W0Q7 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USPL1Q5W0Q7 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USPL1Q5W0Q7 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USPL1Q5W0Q7 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USPL1Q5W0Q7 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USPL1Q5W0Q7 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USPL1Q5W0Q7 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms