Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00303Q3SY05 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00303Q3SY05 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00303Q3SY05 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00303Q3SY05 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00303Q3SY05 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00303Q3SY05 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00303Q3SY05 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00303Q3SY05 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00303Q3SY05 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00303Q3SY05 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00303Q3SY05 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00303Q3SY05 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00303Q3SY05 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00303Q3SY05 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00303Q3SY05 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00303Q3SY05 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00303Q3SY05 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00303Q3SY05 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00303Q3SY05 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00303Q3SY05 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00303Q3SY05 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00303Q3SY05 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00303Q3SY05 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00303Q3SY05 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00303Q3SY05 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms