Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PCK2Q16822 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PCK2Q16822 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms