Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE3CQ15386 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
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