Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BECN1Q14457 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BECN1Q14457 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms