Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
UBE4AQ14139 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE4AQ14139 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms