Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOFQ13790 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOFQ13790 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOFQ13790 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOFQ13790 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
APOFQ13790 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOFQ13790 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOFQ13790 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
APOFQ13790 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOFQ13790 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOFQ13790 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOFQ13790 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOFQ13790 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOFQ13790 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOFQ13790 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOFQ13790 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOFQ13790 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOFQ13790 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOFQ13790 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOFQ13790 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOFQ13790 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOFQ13790 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOFQ13790 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOFQ13790 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOFQ13790 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOFQ13790 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOFQ13790 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOFQ13790 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOFQ13790 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
APOFQ13790 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOFQ13790 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOFQ13790 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOFQ13790 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOFQ13790 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOFQ13790 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOFQ13790 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOFQ13790 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOFQ13790 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
APOFQ13790 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOFQ13790 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
APOFQ13790 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOFQ13790 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOFQ13790 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOFQ13790 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOFQ13790 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOFQ13790 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOFQ13790 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOFQ13790 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOFQ13790 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOFQ13790 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOFQ13790 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOFQ13790 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
APOFQ13790 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOFQ13790 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOFQ13790 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOFQ13790 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOFQ13790 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOFQ13790 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOFQ13790 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOFQ13790 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOFQ13790 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOFQ13790 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOFQ13790 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
APOFQ13790 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOFQ13790 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOFQ13790 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOFQ13790 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOFQ13790 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOFQ13790 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOFQ13790 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOFQ13790 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOFQ13790 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOFQ13790 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
APOFQ13790 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOFQ13790 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOFQ13790 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOFQ13790 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
APOFQ13790 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOFQ13790 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOFQ13790 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOFQ13790 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOFQ13790 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOFQ13790 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOFQ13790 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOFQ13790 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOFQ13790 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOFQ13790 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOFQ13790 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOFQ13790 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOFQ13790 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOFQ13790 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOFQ13790 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOFQ13790 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOFQ13790 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOFQ13790 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOFQ13790 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOFQ13790 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOFQ13790 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
APOFQ13790 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOFQ13790 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
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