Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

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Length 388 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HTR4Q13639 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HTR4Q13639 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
HTR4Q13639 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
HTR4Q13639 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HTR4Q13639 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HTR4Q13639 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
HTR4Q13639 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
HTR4Q13639 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
HTR4Q13639 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HTR4Q13639 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
HTR4Q13639 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HTR4Q13639 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HTR4Q13639 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
HTR4Q13639 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HTR4Q13639 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HTR4Q13639 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HTR4Q13639 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HTR4Q13639 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HTR4Q13639 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HTR4Q13639 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HTR4Q13639 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HTR4Q13639 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
HTR4Q13639 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
HTR4Q13639 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HTR4Q13639 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HTR4Q13639 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HTR4Q13639 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HTR4Q13639 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HTR4Q13639 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HTR4Q13639 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
HTR4Q13639 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
HTR4Q13639 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
HTR4Q13639 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HTR4Q13639 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HTR4Q13639 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HTR4Q13639 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HTR4Q13639 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HTR4Q13639 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HTR4Q13639 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HTR4Q13639 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HTR4Q13639 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HTR4Q13639 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HTR4Q13639 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HTR4Q13639 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
HTR4Q13639 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HTR4Q13639 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HTR4Q13639 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HTR4Q13639 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HTR4Q13639 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HTR4Q13639 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HTR4Q13639 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HTR4Q13639 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HTR4Q13639 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
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HTR4Q13639 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
HTR4Q13639 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
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HTR4Q13639 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HTR4Q13639 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
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HTR4Q13639 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HTR4Q13639 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HTR4Q13639 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HTR4Q13639 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HTR4Q13639 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HTR4Q13639 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HTR4Q13639 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HTR4Q13639 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HTR4Q13639 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HTR4Q13639 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HTR4Q13639 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HTR4Q13639 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HTR4Q13639 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HTR4Q13639 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HTR4Q13639 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HTR4Q13639 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HTR4Q13639 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HTR4Q13639 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HTR4Q13639 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HTR4Q13639 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HTR4Q13639 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HTR4Q13639 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HTR4Q13639 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
HTR4Q13639 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
HTR4Q13639 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HTR4Q13639 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HTR4Q13639 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HTR4Q13639 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HTR4Q13639 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HTR4Q13639 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HTR4Q13639 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HTR4Q13639 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HTR4Q13639 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
HTR4Q13639 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HTR4Q13639 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HTR4Q13639 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HTR4Q13639 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HTR4Q13639 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HTR4Q13639 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms