Protein–RNA interactions for Protein: P59044

NLRP6, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP6P59044 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
NLRP6P59044 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NLRP6P59044 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NLRP6P59044 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NLRP6P59044 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NLRP6P59044 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NLRP6P59044 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NLRP6P59044 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NLRP6P59044 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NLRP6P59044 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NLRP6P59044 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NLRP6P59044 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NLRP6P59044 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NLRP6P59044 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NLRP6P59044 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NLRP6P59044 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NLRP6P59044 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NLRP6P59044 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NLRP6P59044 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NLRP6P59044 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NLRP6P59044 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NLRP6P59044 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NLRP6P59044 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NLRP6P59044 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NLRP6P59044 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NLRP6P59044 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NLRP6P59044 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NLRP6P59044 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NLRP6P59044 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NLRP6P59044 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NLRP6P59044 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NLRP6P59044 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NLRP6P59044 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NLRP6P59044 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NLRP6P59044 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NLRP6P59044 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NLRP6P59044 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NLRP6P59044 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NLRP6P59044 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NLRP6P59044 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NLRP6P59044 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NLRP6P59044 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NLRP6P59044 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NLRP6P59044 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NLRP6P59044 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NLRP6P59044 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NLRP6P59044 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NLRP6P59044 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NLRP6P59044 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NLRP6P59044 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NLRP6P59044 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NLRP6P59044 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NLRP6P59044 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NLRP6P59044 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NLRP6P59044 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NLRP6P59044 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NLRP6P59044 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NLRP6P59044 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NLRP6P59044 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NLRP6P59044 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NLRP6P59044 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NLRP6P59044 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NLRP6P59044 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NLRP6P59044 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NLRP6P59044 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NLRP6P59044 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NLRP6P59044 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NLRP6P59044 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NLRP6P59044 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NLRP6P59044 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NLRP6P59044 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NLRP6P59044 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NLRP6P59044 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NLRP6P59044 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NLRP6P59044 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NLRP6P59044 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NLRP6P59044 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NLRP6P59044 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NLRP6P59044 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NLRP6P59044 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NLRP6P59044 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NLRP6P59044 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NLRP6P59044 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NLRP6P59044 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NLRP6P59044 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NLRP6P59044 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NLRP6P59044 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NLRP6P59044 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NLRP6P59044 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NLRP6P59044 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NLRP6P59044 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NLRP6P59044 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NLRP6P59044 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NLRP6P59044 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NLRP6P59044 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NLRP6P59044 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NLRP6P59044 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NLRP6P59044 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NLRP6P59044 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NLRP6P59044 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms