Protein–RNA interactions for Protein: P55008

AIF1, Allograft inflammatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AIF1P55008 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AIF1P55008 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AIF1P55008 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
AIF1P55008 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
AIF1P55008 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
AIF1P55008 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
AIF1P55008 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
AIF1P55008 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
AIF1P55008 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
AIF1P55008 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
AIF1P55008 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
AIF1P55008 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
AIF1P55008 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
AIF1P55008 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
AIF1P55008 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
AIF1P55008 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
AIF1P55008 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
AIF1P55008 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
AIF1P55008 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
AIF1P55008 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
AIF1P55008 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
AIF1P55008 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
AIF1P55008 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
AIF1P55008 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
AIF1P55008 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
AIF1P55008 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
AIF1P55008 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
AIF1P55008 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
AIF1P55008 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
AIF1P55008 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
AIF1P55008 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
AIF1P55008 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
AIF1P55008 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
AIF1P55008 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
AIF1P55008 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AIF1P55008 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
AIF1P55008 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
AIF1P55008 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AIF1P55008 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
AIF1P55008 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AIF1P55008 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AIF1P55008 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AIF1P55008 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
AIF1P55008 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
AIF1P55008 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AIF1P55008 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AIF1P55008 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
AIF1P55008 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AIF1P55008 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
AIF1P55008 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
AIF1P55008 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
AIF1P55008 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AIF1P55008 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
AIF1P55008 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
AIF1P55008 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AIF1P55008 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AIF1P55008 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
AIF1P55008 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
AIF1P55008 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AIF1P55008 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
AIF1P55008 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AIF1P55008 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AIF1P55008 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AIF1P55008 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
AIF1P55008 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
AIF1P55008 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
AIF1P55008 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
AIF1P55008 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AIF1P55008 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
AIF1P55008 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AIF1P55008 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
AIF1P55008 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
AIF1P55008 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AIF1P55008 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AIF1P55008 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
AIF1P55008 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
AIF1P55008 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AIF1P55008 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
AIF1P55008 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
AIF1P55008 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
AIF1P55008 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AIF1P55008 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
AIF1P55008 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AIF1P55008 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AIF1P55008 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AIF1P55008 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AIF1P55008 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
AIF1P55008 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AIF1P55008 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AIF1P55008 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AIF1P55008 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AIF1P55008 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AIF1P55008 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AIF1P55008 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AIF1P55008 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AIF1P55008 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
AIF1P55008 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AIF1P55008 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AIF1P55008 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
AIF1P55008 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms