Protein–RNA interactions for Protein: P35499

SCN4A, Sodium channel protein type 4 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,836 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN4AP35499 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCN4AP35499 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCN4AP35499 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCN4AP35499 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCN4AP35499 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCN4AP35499 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCN4AP35499 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCN4AP35499 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCN4AP35499 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCN4AP35499 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCN4AP35499 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCN4AP35499 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCN4AP35499 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCN4AP35499 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCN4AP35499 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCN4AP35499 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SCN4AP35499 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCN4AP35499 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCN4AP35499 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SCN4AP35499 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SCN4AP35499 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
SCN4AP35499 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SCN4AP35499 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SCN4AP35499 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SCN4AP35499 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SCN4AP35499 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SCN4AP35499 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SCN4AP35499 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
SCN4AP35499 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SCN4AP35499 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SCN4AP35499 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SCN4AP35499 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
SCN4AP35499 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SCN4AP35499 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
SCN4AP35499 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SCN4AP35499 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SCN4AP35499 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SCN4AP35499 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCN4AP35499 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCN4AP35499 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCN4AP35499 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCN4AP35499 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCN4AP35499 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCN4AP35499 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCN4AP35499 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCN4AP35499 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCN4AP35499 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCN4AP35499 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCN4AP35499 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCN4AP35499 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCN4AP35499 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCN4AP35499 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SCN4AP35499 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCN4AP35499 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCN4AP35499 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCN4AP35499 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCN4AP35499 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCN4AP35499 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCN4AP35499 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCN4AP35499 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCN4AP35499 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCN4AP35499 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCN4AP35499 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCN4AP35499 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCN4AP35499 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCN4AP35499 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SCN4AP35499 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCN4AP35499 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCN4AP35499 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCN4AP35499 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCN4AP35499 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCN4AP35499 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCN4AP35499 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCN4AP35499 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SCN4AP35499 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCN4AP35499 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCN4AP35499 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCN4AP35499 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SCN4AP35499 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SCN4AP35499 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCN4AP35499 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SCN4AP35499 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCN4AP35499 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCN4AP35499 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCN4AP35499 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCN4AP35499 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCN4AP35499 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCN4AP35499 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCN4AP35499 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCN4AP35499 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCN4AP35499 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCN4AP35499 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SCN4AP35499 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCN4AP35499 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SCN4AP35499 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCN4AP35499 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCN4AP35499 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCN4AP35499 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCN4AP35499 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCN4AP35499 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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