Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SDSP20132 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SDSP20132 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SDSP20132 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SDSP20132 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SDSP20132 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SDSP20132 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SDSP20132 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SDSP20132 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDSP20132 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDSP20132 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDSP20132 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDSP20132 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDSP20132 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDSP20132 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDSP20132 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDSP20132 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDSP20132 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDSP20132 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SDSP20132 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDSP20132 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDSP20132 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDSP20132 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDSP20132 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDSP20132 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDSP20132 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDSP20132 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDSP20132 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SDSP20132 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDSP20132 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDSP20132 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDSP20132 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDSP20132 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDSP20132 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDSP20132 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDSP20132 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDSP20132 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDSP20132 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDSP20132 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDSP20132 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDSP20132 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDSP20132 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDSP20132 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDSP20132 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDSP20132 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDSP20132 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDSP20132 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDSP20132 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDSP20132 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDSP20132 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDSP20132 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDSP20132 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDSP20132 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDSP20132 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDSP20132 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SDSP20132 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SDSP20132 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDSP20132 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDSP20132 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDSP20132 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDSP20132 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDSP20132 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDSP20132 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDSP20132 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDSP20132 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDSP20132 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDSP20132 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SDSP20132 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SDSP20132 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SDSP20132 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SDSP20132 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SDSP20132 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SDSP20132 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SDSP20132 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SDSP20132 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SDSP20132 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SDSP20132 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SDSP20132 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SDSP20132 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SDSP20132 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SDSP20132 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SDSP20132 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SDSP20132 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
SDSP20132 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SDSP20132 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDSP20132 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDSP20132 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SDSP20132 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDSP20132 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDSP20132 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDSP20132 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SDSP20132 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SDSP20132 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDSP20132 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDSP20132 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDSP20132 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDSP20132 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDSP20132 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SDSP20132 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDSP20132 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms