Protein–RNA interactions for Protein: P10070

GLI2, Zinc finger protein GLI2, humanhuman

Predictions only

Length 1,586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI2P10070 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GLI2P10070 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GLI2P10070 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GLI2P10070 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GLI2P10070 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GLI2P10070 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GLI2P10070 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GLI2P10070 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GLI2P10070 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GLI2P10070 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GLI2P10070 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GLI2P10070 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GLI2P10070 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GLI2P10070 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GLI2P10070 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GLI2P10070 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GLI2P10070 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GLI2P10070 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GLI2P10070 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GLI2P10070 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GLI2P10070 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GLI2P10070 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GLI2P10070 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GLI2P10070 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GLI2P10070 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GLI2P10070 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GLI2P10070 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GLI2P10070 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GLI2P10070 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GLI2P10070 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GLI2P10070 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
GLI2P10070 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GLI2P10070 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GLI2P10070 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GLI2P10070 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GLI2P10070 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GLI2P10070 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GLI2P10070 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GLI2P10070 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GLI2P10070 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GLI2P10070 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
GLI2P10070 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GLI2P10070 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GLI2P10070 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GLI2P10070 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GLI2P10070 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GLI2P10070 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GLI2P10070 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GLI2P10070 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GLI2P10070 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GLI2P10070 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GLI2P10070 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
GLI2P10070 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
GLI2P10070 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GLI2P10070 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GLI2P10070 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GLI2P10070 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GLI2P10070 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GLI2P10070 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GLI2P10070 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GLI2P10070 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GLI2P10070 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GLI2P10070 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GLI2P10070 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GLI2P10070 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
GLI2P10070 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GLI2P10070 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GLI2P10070 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GLI2P10070 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GLI2P10070 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GLI2P10070 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GLI2P10070 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GLI2P10070 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GLI2P10070 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GLI2P10070 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GLI2P10070 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GLI2P10070 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GLI2P10070 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GLI2P10070 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
GLI2P10070 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GLI2P10070 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GLI2P10070 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GLI2P10070 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
GLI2P10070 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GLI2P10070 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GLI2P10070 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GLI2P10070 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GLI2P10070 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GLI2P10070 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
GLI2P10070 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GLI2P10070 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GLI2P10070 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GLI2P10070 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GLI2P10070 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
GLI2P10070 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GLI2P10070 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GLI2P10070 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GLI2P10070 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GLI2P10070 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GLI2P10070 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms