Protein–RNA interactions for Protein: O95263

PDE8B, High affinity cAMP-specific and IBMX-insensitive 3',5'-cyclic phosphodiesterase 8B, humanhuman

Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE8BO95263 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE8BO95263 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE8BO95263 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE8BO95263 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE8BO95263 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDE8BO95263 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE8BO95263 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE8BO95263 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE8BO95263 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE8BO95263 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE8BO95263 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE8BO95263 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE8BO95263 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE8BO95263 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE8BO95263 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE8BO95263 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE8BO95263 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE8BO95263 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE8BO95263 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE8BO95263 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE8BO95263 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDE8BO95263 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE8BO95263 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE8BO95263 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE8BO95263 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE8BO95263 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE8BO95263 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE8BO95263 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE8BO95263 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE8BO95263 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE8BO95263 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE8BO95263 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE8BO95263 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE8BO95263 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE8BO95263 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE8BO95263 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE8BO95263 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE8BO95263 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE8BO95263 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE8BO95263 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE8BO95263 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE8BO95263 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE8BO95263 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE8BO95263 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE8BO95263 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE8BO95263 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE8BO95263 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE8BO95263 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE8BO95263 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE8BO95263 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE8BO95263 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE8BO95263 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE8BO95263 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE8BO95263 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE8BO95263 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE8BO95263 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE8BO95263 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE8BO95263 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE8BO95263 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE8BO95263 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE8BO95263 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE8BO95263 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE8BO95263 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE8BO95263 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE8BO95263 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE8BO95263 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE8BO95263 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE8BO95263 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE8BO95263 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE8BO95263 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE8BO95263 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE8BO95263 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE8BO95263 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE8BO95263 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE8BO95263 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE8BO95263 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE8BO95263 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE8BO95263 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE8BO95263 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE8BO95263 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE8BO95263 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE8BO95263 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE8BO95263 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE8BO95263 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE8BO95263 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE8BO95263 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE8BO95263 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE8BO95263 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE8BO95263 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE8BO95263 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE8BO95263 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE8BO95263 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE8BO95263 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE8BO95263 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE8BO95263 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE8BO95263 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE8BO95263 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE8BO95263 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE8BO95263 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE8BO95263 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms